背景说明

背景说明

ChIP的原理是在生理状态下把细胞内的DNA与蛋白质交联在一起,通过超声或酶处理,将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段,利用抗原抗体的特异性识别反应,将与目的蛋白相结合的DNA片段沉淀下来,随后,特异性富集目的蛋白结合的DNA片段,通过对目的片段的纯化与检测,从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。

一旦完成染色质免疫沉淀,便可对纯化的染色质及有关蛋白、组蛋白、转录因子和辅因子进行多种下游分析。最常见的单基因分析和全基因组分析方法有ChIP-qPCR、ChIP-seq、ChIP-PCR、ChIP-芯片(ChIP-chip)检测等。

图 ChIP实验技术流程图(Giaimo et al., 2017)。

服务流程

服务内容及说明

服务内容及说明

适用范围

1、研究目的蛋白与已知靶序列间的相互作用;

2、研究目的蛋白与整个基因组未知序列的相互作用;

3、研究一个目的蛋白与DNA的相互作用;

4、研究两个蛋白与DNA共同结合的相互作用;

5、研究启动子区域的组蛋白的修饰;

6、研究结合在DNA序列上的蛋白复合物。

ChIP的优点

(1)可检测启动子DNA与其天然基因组状态下的转录因子间的相互作用;

(2)可检测组蛋白编码(即组蛋白乙酰化、三甲基化等)和离散染色质区域的转录因子翻译后修饰;

(3)可最大限度减少制备和沉淀过程中染色质重排的机会;

(4)基因特异性引物可用于后续PCR检测,特异性增加。

ChIP的缺点

(1)耗时较长,通常需要几天才能完成检测;

(2)存在抗体无效性。

客户下单及项目信息填写

在我司官网http://www.biorun.com/进行注册或登录,请客户按照页面提示填写项目名称、选择项目类型、填写个人信息及联系方式,提交项目所需要的具体信息,包括:

1、组织、细胞等样品、ChIP检测专用抗体(也可以选择由我司提供)及结合靶点等相关信息;

2、最终检测方式;

3、尽可能丰富的相关资料、文献。

实验信息

实验过程中客户可以随时登入管理系统查看项目实时进展情况。实验结题时系统会通过短信自动通知客户,并发送实验报告查看网址。实验结题后,实验报告,检测结果可在线查看或打印,并永久保留。

实验周期

致电详询

实验交付内容

1、所有实验的原始数据(包括实验过程、实验试剂与设备等);

2、ChIP电子图片及分析结果;

3、相互作用鉴定结果,可选ChIP-qPCR、ChIP-seq、ChIP-PCR和(或)ChIP-chip鉴定结果。

参考文献

参考文献

Giaimo BD, Ferrante F, Borggrefe T. Chromatin Immunoprecipitation (ChIP) in Mouse T-cell Lines. J Vis Exp. 2017;(124):55907.

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