我司是国家级专精特新小巨人企业，国家级重点实验室，牵头多项省部级重大专项，公司科研技术人员500+（硕博占比40%以上），作为功能基因研究综合性平台， 15年技术沉淀，每年完成功能基因研究数量50000+，长期服务课题组10000+（含协和、同济、华西、湘雅、中山、军事医学院等顶尖医学研究机构） ，各类仪器设备投资超1个亿

参考文献

Shuken SR, Rutledge J, Iram T, Losada PM, Wilson EN, Andreasson KI, Leib RD, Wyss-Coray T. Limited Proteolysis-Mass Spectrometry Reveals Aging-Associated Changes in Cerebrospinal Fluid Protein Abundances and Structures. Nat Aging. 2022 May;2(5):379-388.

Elsässer F, Florea R, Räsch F, Zedan M, Sen NE, Pflästerer T, Kleele T, Loewith R, Weis K, de Souza N, Picotti P. Limited proteolysis-coupled mass spectrometry captures proteome-wide protein structural alterations and biomolecular condensation in living cells. Mol Syst Biol. 2026 Mar;22(3):337-368.

背景说明

在传统的结构生物学中，科学家如果要研究蛋白质的构象变化（例如：蛋白质在结合了药物小分子、发生翻译后修饰、或在不同代谢环境下的结构改变），通常需要依赖 X 射线晶体学（Cryo-X）、核磁共振（NMR）或冷冻电镜（Cryo-EM）。然而，这些传统结构生物学方法

无法在体内（In situ）或全细胞裂解液中进行，它们通常需要纯化出高纯度、高浓度的单一蛋白质。另外它们通量极低，无法同时观察细胞内成千上万种蛋白质的构象变化。在活细胞内部，蛋白质的构象是动态变化的，许多疾病（如阿尔茨海默病中的蛋白错误折叠）正是由构象异常引起的。因此，科学界急需一种能够在大规模蛋白质组水平上、直接在复杂生物样本中探测蛋白质结构变化的技术，LiP-MS 应运而生。

LiP-MS有两个核心步骤：

1、有限蛋白酶解（Limited Proteolysis, LiP）：

在天然（非变性）状态的细胞裂解液中，加入低浓度、低特异性的蛋白酶（如 Proteinase K）。这种酶切反应只持续很短的时间。蛋白酶只能切割那些暴露在蛋白质表面、结构柔性较大（Flexible）的特定位点，而包裹在内部的紧密结构域则被保护下来。如果此时蛋白质由于结合了药物分子而改变了构象，其表面的酶切位点就会发生改变。

2、完全变性与常规质谱分析（MS）：

反应结束后，立刻加入变性剂终止反应。随后，使用高特异性的胰蛋白酶（Trypsin）进行常规的完全酶切，将所有蛋白彻底打碎成肽段。质谱定量：利用液质联用（LC-MS/MS）对肽段进行定量分析。

如果某个蛋白质在“加药前后”结构发生了变化，那么经过两轮酶切后，质谱检测到的特定半特异性肽段（Fully or Semi-tryptic peptides）的丰度就会发生显著改变。通过追踪这些肽段，就能以氨基酸级别的分辨率精确定位出蛋白质的构象变化区域或药物结合位点。

图2 LiP-MS的技术原理 (Elsässer et al., 2026)

服务内容及说明

适用范围

小分子药物靶点识别与表征，蛋白质构象病与错误折叠研究，营养学与代谢物-蛋白质相互作用，生物大分子相互作用研究等。适用于细胞裂解液，组织样本，不同处理条件比较（药物/突变/应激）等复杂体系。

技术优势

（1）全蛋白组范围（proteome-wide）结构信息获取；

（2）可检测蛋白构象变化（不仅是表达量变化），LiP-MS关注蛋白折叠状态变化，构象暴露/隐藏位点变化和复合物形成导致的结构改变；

（3）能识别蛋白–小分子/药物靶点：不依赖标签或修饰，可识别药物结合导致的构象改变的蛋白。

客户下单及项目信息填写

在我司官网http://www.biorun.com/进行注册或登录，请客户按照页面提示填写：

1、项目名称、选择项目类型、填写个人信息及联系方式进行预提交；

2、提交项目所需要的具体信息：样本信息，处理方式等。

实验信息

实验过程中客户可以随时登入管理系统查看项目实时进展情况。实验结题时系统会通过短信自动通知客户，并发送实验报告查看网址。实验结题后，实验报告、检测结果可在线查看或打印，并永久保留。

实验周期

致电详询

实验交付内容

原始数据及结果分析