背景说明
基于多重PCR建库技术,对靶标区间进行两轮PCR来达到建库和富集的目的(如下图所示)。基本的实验步骤如下:
1、针对靶位点区间设计特异性引物,可以在上下游特异性引物带上barcode序列,方便多样品混合;
2、利用步骤1针对靶位点所设计的特异性引物,对目的片段进行首轮PCR,获得目的片段;
3、以步骤2中扩增获得片段为基础,进行第二轮PCR扩增,加上测序接头;
4、混样后,即可送高通量测序;
5、对测序结果进行分析。
图 多重PCR建库流程
服务流程
客户在线下单——订单确认——构建高通量测序文件——高通量测序——结果分析——上传检测结果——打印实验报告
服务内容及说明
适用范围
1、适用于动植物、微生物等基因编辑材料的鉴定分析;
2、适用于需要对大批量基因编辑样品进行检测分析;
3、适用于鉴定分析敲除效率低的编辑系统,如先导编辑(Prime editor,PE)系统,可以极大的节省成本;
4、可以为开发新的编辑系统检测编辑效率提供服务。
我司优势及特点
简单、便捷:客户只需要提供原始的材料(植物组织、动物细胞组织等);
兼容:测序数据不仅可以在我司进行分析解读,也适用于其他分析平台;
精准:测序数据通量高、数据大,可得到最真实的结果。
一代与二代测序鉴定突变体的方法比较
客户下单及项目信息填写
在我司官网http://www.biorun.com/进行注册或登录,请客户按照页面提示填写:
1、项目名称、选择项目类型、填写个人信息及联系方式进行预提交;
2、提交项目所需要的具体信息,主要是细胞名称、样品总数、检测区域基因组。
实验周期
致电详询
实验交付与标准
1、提供每个样品的原始测序数据;
2、由本公司建立的分析方法解读的分析结果:序列表(包含每个样品的支持reads数、突变情况和序列);
3、可根据客户需求,提供每个样品的复核比对结果图片。
图 序列表
注:M: 完全匹配;D:碱基缺失;I:碱基插入;SNP通过比对图展示
注意事项
1、组织速冻时间:组织离体后,胞内核酸便开始降解,尤其是RNA,故采集时,目的组织离体后,需立即速冻,建议5min内完成,越快越好。
2、组织送样量:送样量过少或过多均不利于提取实验,下限为建议量的一半,上限为建议量的3倍。
3、组织保存管的选择:所有组织样品务必使用离心管或螺纹管保存,切勿直接装入密封袋保存(低温冻脆易破裂,导致样品泄露,交叉污染)。
4、组织样品保存方法选择:首选液氮速冻;没有液氮条件的,可直接放入-80℃冰箱冻存。
5、冻融组织:组织冻存后,一旦冻融,RNA降解概率大于80%,几乎不可能提取成功,此类组织不建议送样。送样前确保组织未发生过冻融情况。
6、对于同一个组织样品需要同时提取DNA和RNA的,请务必分成两管分批次送样。