背景说明
DNA甲基化作为关键的表观遗传修饰机制,在基因表达调控、细胞分化、个体发育及疾病发生发展等生物学过程中具有核心调控作用。从分子层面来看,研究领域通常关注的DNA甲基化特指CpG位点(即DNA序列中胞嘧啶-鸟嘌呤二核苷酸位点)的胞嘧啶第5位碳原子甲基化,其修饰产物为5-甲基胞嘧啶(5-mC)。这种修饰形式在进化上高度保守,广泛存在于植物、动物等真核生物基因组中,因其丰度高、调控功能明确,目前已成为表观遗传学研究中最受关注的甲基化修饰类型。
亚硫酸氢盐测序PCR(Bisulfite Sequencing PCR,BSP)是DNA甲基化检测领域的经典技术,其核心原理是通过亚硫酸氢盐(Bisulfite)处理将未甲基化的胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(U),而甲基化的5-甲基胞嘧啶(5-mC)保持不变,再结合第一代测序技术对目标区域进行高精度分析。具体流程包括:针对目的片段设计特异性引物进行PCR扩增,将扩增产物通过TA克隆构建文库,并筛选阳性克隆进行测序,最终通过序列比对计算特定CpG位点的甲基化水平。
图 BSP检测甲基化原理示意图
服务流程
订单/实验材料确认——样品处理——提取基因组DNA——基因组DNA的Bisulfite转化——引物设计与合成——TA克隆测序——数据分析——结果交付
服务内容及说明
实验周期
致电详询
客户下单及项目信息填写
在我司官网http://www.biorun.com/进行注册或登录,请客户按照页面提示填写项目名称、选择项目类型、填写个人信息及联系方式,提交项目所需要的具体信息(可联系区域销售经理)。
实验信息
实验过程中客户可以随时登入管理系统查看项目实时进展情况。实验结题时系统会通过短信自动通知客户,并发送实验报告查看网址。实验结题后,实验报告、检测结果可在线查看或打印,并永久保留。
实验交付内容
1、Bisulfite处理的基因组DNA;
2、包含实验步骤的详细实验报告;
3、5个有效的阳性克隆;
4、甲基化分析结果点状图;
5、测序结果。
案例展示
图 PM2.5诱发心肌ADRB2高甲基化,导致β2AR表达下调(BSP验证)(Yang et al., 2019)。
参考文献
Yang X, Zhao T, Feng L, et al. PM2. 5-induced ADRB2 hypermethylation contributed to cardiac dysfunction through cardiomyocytes apoptosis via PI3K/Akt pathway[J]. Environment international, 2019, 127: 601-614.