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下单说明
我司是国家级专精特新小巨人企业,国家级重点实验室,牵头多项省部级重大专项,公司科研技术人员500+(硕博占比40%以上),作为功能基因研究综合性平台, 15年技术沉淀,每年完成功能基因研究数量50000+,长期服务课题组10000+(含协和、同济、华西、湘雅、中山、军事医学院等顶尖医学研究机构) ,各类仪器设备投资超1个亿
我司案例
小分子和蛋白的分子对接服务:
表1. 对接自由能
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Rank |
1 |
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9 |
10 |
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Score(Kcaj/Mol) |
-6.3 |
-5.7 |
-4.1 |
-3.9 |
-3.9 |
-3.8 |
-3.8 |
-3.5 |
-3.5 |

图1. 对接结构(surface + Cartoon)示意图
背景说明
蛋白质是机体关键的药物作用靶点,小分子化合物通过与靶蛋白特异性结合发挥生物学效应。常规体外湿实验仅能验证小分子宏观生物活性,无法直观反映二者原子层面的微观结合机制,且存在研发成本高、周期长的问题。小分子-蛋白分子对接作为常用计算机辅助分子模拟技术,依托蛋白三维结构,模拟生理环境下小分子与靶蛋白的识别结合过程,快速预测二者结合亲和力与结合模式,有效弥补传统实验的不足,为探究小分子与靶蛋白相互作用机制提供重要的计算分析手段。
分子对接(Molecular Docking,MD)基于分子识别理论,遵循空间结构互补与热力学能量最低原理,兼顾蛋白与小分子结合时的构象柔性变化,通过算法搜索小分子最优结合构象,结合打分函数评估结合自由能。分子对接可直观分析氢键、疏水作用等非共价作用力,定位关键结合氨基酸残基,从分子层面阐明小分子作用靶点的内在机制并提供可靠的理论支撑。

图2. 配体-蛋白质对接示意图(Ma Z et al., 2024)
服务流程
客户在线下单——订单确认——小分子结构获取——蛋白三维结构获取——分子对接——结果分析
服务流程
客户在线下单——订单确认——小分子结构获取——蛋白三维结构获取——分子对接——结果分析
服务内容及说明
适用范围
分子对接(molecular docking)本质上是预测两个或多个分子之间的结合构象与结合能力的一类计算方法,适用于蛋白–小分子对接、蛋白–蛋白对接,需要靶点结构已知以及相互作用主要由非共价键驱动这两个核心前提。
技术优势
(1)无需昂贵实验耗材,可在短时间内完成上万种化合物同步筛选;
(2)能够从原子层面直观解析药物结合机制,弥补体外实验无法观测微观分子相互作用的短板;
(3)提前预判化合物脱靶风险,大幅降低药物研发后期失败概率。
客户下单及项目信息填写
在我司官网http://www.biorun.com/进行注册或登录,请客户按照页面提示填写:
1、项目名称、选择项目类型、填写个人信息及联系方式进行预提交;
2、提交项目所需要的具体信息:小分子信息和蛋白序列信息
实验信息
实验过程中客户可以随时登入管理系统查看项目实时进展情况。实验结题时系统会通过短信自动通知客户,并发送实验报告查看网址。实验结题后,实验报告、检测结果可在线查看或打印,并永久保留。
实验周期
致电详询
实验交付内容
分子对接详细实验报告及结果分析