背景说明

背景说明

 基因编辑是一种能改变生物体基因组序列的基因工程技术,主要通过人工核酸内切酶实现对基因组特定基因序列的敲除、插入或精确修饰。目前,基因编辑主要有三种方法:锌指核酸酶技术(ZFN)、转录激活效应因子核酸酶(TALEN)技术和CRISPR/Cas系统介导的基因编辑技术。进行基因编辑时,人工核酸内切酶能够识别并切断靶DNA序列,产生DNA双链断裂(Double-strand break,DSB),然后细胞会进行及时修复,主要有两种修复途径:非同源末端连接(Non-homologous end joining, NHEJ)和同源重组(Homologous directed repair, HDR)。通过HDR修复DSB时,细胞修复系统会将额外提供的一个与靶DNA两侧同源的外源片段作为模板,在DSB处合成与同源序列互补的基因序列,由于外源片段中携带待敲入的突变或目的基因,因此就可以在基因组中精确地引入点突变,或者插入目的基因,称之为基因敲入(Knock in,KI)。

图 CRISPR/Cas9基因编辑机制(Yanxin X et al.,2022)。

基因敲入是指将一个新的基因或DNA序列插入到基因组中的一个特定位置。可以通过同源重组、病毒载体或CRISPR/Cas9来实现。同源重组介导的基因敲入需要将一个包含所需基因序列的修饰DNA片段引入到目标位点病毒载体,如逆转录病毒或腺相关病毒(AAVs),可以用来将新基因传递到基因组中CRISPR/Cas9也可以通过使用供体DNA模板以及sgRNA和Cas9酶来插入一个基因。

基于CRISPR-Cas9的基因敲入(KI)

原理:当Cas9内切酶切割双链DNA时,同时提供一段与靶基因高度同源的DNA修复模板,生物体即可启动HDR修复路径。这段模板可以是单链DNA(ssDNA),也可以是双链DNA(dsDNA),上面包含一段目的序列,其两侧序列与切口附近的基因组序列一致,因此可以作为同源臂将一段DNA序列精准地插入特定的基因组位点,从而实现精确的基因敲入。

图 基于CRISPR/Cas9基因敲入的示意图(Murillo-Rodríguez E et al., 2018)。

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实验周期

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实验交付内容

1、所有实验的原始数据(包括实验过程、实验试剂与设备等);

2、敲入载体:一份质粒、一份大肠杆菌菌液(25%甘油菌);

3、敲入载体的全序列信息和注释信息;

4、敲入载体的酶切图谱;

5、敲入载体测序结果;

6、后续所有实验的相关结果(靶点三包一至少有效果)。

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