背景说明

生物体内的蛋白质很少单独行使功能，蛋白质之间会形成复合物来发挥功能。因此，蛋白质间的相互作用是细胞中最基本的活动，被称为互作蛋白质组，互作蛋白质组分析是指在组学水平上对相互作用的蛋白质进行分析。

相互作用蛋白质组学是蛋白质组学主要研究内容中的一项，是指从整体水平上分析一个有机体、组织或细胞中的蛋白质相互作用（PPIs）。遗传信息的复制表达、各类物质的代谢、细胞信号转导，以及蛋白质自身的合成、转运、降解等等都与蛋白质相互作用有关。研究蛋白质的相互作用，可以让我们更准确的认识蛋白质的功能及其发挥功能的机制，并进一步认识生物体生命过程的调节方式及其机制。

通过LC-MS/MS技术对IP、Co-IP、Pull-down等技术得到样本中的蛋白混合物进行鉴定，可同时鉴定目的蛋白及其相互作用蛋白，从而构建蛋白质相互作用谱。该技术既适用于蛋白混合物的SDS-PAGE分离后经胶内酶解的质谱分析，也适用蛋白混合物溶液内液体酶解的质谱分析。

IP-MS（Immunoprecipitation-Mass Spectrometry）即免疫沉淀-质谱联用技术，其原理是以细胞内源性靶蛋白为诱饵，将靶蛋白抗体与细胞总蛋白进行孵育，促进免疫复合物的形成。随后加入能够与抗体结合的protein-A/G（预先结合固化在琼脂小球或磁珠上），形成“结合蛋白-靶蛋白-靶蛋白抗体-protein-A/G小珠”复合物，将复合物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE）以分离蛋白，然后进行液相色谱-质谱联用，对酶解后的肽段进行质谱分析，从而分析出与目的蛋白相互作用的未知蛋白。

服务内容及说明

适用范围

蛋白质相互作用谱鉴定。

实验流程

客户在线下单——订单/实验材料确认——亲和纯化——LC-MS/MS——数据分析——互作蛋白确认——交付结果

实验周期

致电详询

客户下单及项目信息填写

在我司官网http://www.biorun.com/进行注册或登录，请客户按照页面提示填写项目名称、选择项目类型、填写个人信息及联系方式，提交项目所需要的具体信息，包括：

1、样品来源、含量、状态及其他基本信息；

2、尽可能丰富的相关资料、文献。

实验信息

实验过程中客户可以随时登入管理系统查看项目实时进展情况。实验结题时系统会通过短信自动通知客户，并发送实验报告查看网址。实验结题后，实验报告、检测结果可在线查看或打印，并永久保留。

实验交付内容

1、所有实验的原始数据（包括实验过程、实验试剂与设备等）；

2、生物信息学分析内容包括：

（1）蛋白质全谱鉴定；

（2）蛋白质表达量差异分析；

（3）差异蛋白筛选；

（4）PCA分析、聚类分析。