背景说明

DNA甲基化是第一个被发现的表观遗传标记，直到现在仍是研究较多的表观遗传标记。在动物中，DNA甲基化主要涉及在二核苷酸CpG的胞嘧啶（C）残基的C5位置上添加一个甲基，并与转录活性的抑制有关。

图 亚硫酸氢盐催化C转化为U的化学反应概要。

原理简介

BS-seq即在测序之前使用亚硫酸氢盐处理DNA以确定甲基化水平。其原理主要是，用亚硫酸氢盐处理DNA可将胞嘧啶残基（C）转化为尿嘧啶（U），但5-甲基胞嘧啶残基（5mC）对其有抗性，并不会发生转变。因此，亚硫酸氢盐处理引入了依赖于单个C残基甲基化状态的DNA序列的特定变化，从而产生有关DNA片段甲基化状态的单核苷酸分辨率信息，结合高通量测序技术，与参考序列比对即可检测样本DNA甲基化水平。

WGBS（Whole-genome bisulfite sequencing），其实也是BS-seq。

图 BS-seq检测流程。

服务内容及说明

适用范围

1、发育过程中DNA甲基化变化及其介导的基因表达变化；

2、特定生物学变化（如癌变）前后DNA甲基化变化及其介导的基因表达变化；

3、特定对照-处理前后DNA甲基化变化及其介导的基因表达变化；

4、研究非编码RNA介导的DNA甲基化修饰及其功能。

实验周期

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客户下单及项目信息填写

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1、组织、细胞、DNA等样品来源、状态及其他相关信息；

2、尽可能丰富的相关资料、文献。

实验信息

实验过程中客户可以随时登入管理系统查看项目实时进展情况。实验结题时系统会通过短信自动通知客户，并发送实验报告查看网址。实验结题后，实验报告，检测结果可在线查看或打印，并永久保留。

实验交付内容

1、所有实验的原始数据（包括实验过程、实验试剂与设备等）；

2、表观组学基础数据分析与差异数据分析（生物信息学分析）；

3、生物信息学分析内容包括：原始数据质控、参考基因组比对、全基因组甲基化图谱构建、差异甲基化区域分析、甲基化C序列特征分析、启动子分析、功能富集分析等。

文献示例

图 BS-seq结果（Okada et al., 2022）。

参考文献

Okada T, Sun X, McIlfatrick S, et al. Low guanine content and biased nucleotide distribution in vertebrate mtDNA can cause overestimation of non-CpG methylation. NAR Genom Bioinform. 2022;4(1):lqab119.