背景说明

背景说明

DIA是数据非依赖性数据采集模式,它将扫描范围划分为若干个窗口,通过超高速扫描来获得扫描范围内全部离子的所有碎片信息。以蛋白质组学样品分析中常见的扫描范围400~1200Da为例,每25Da作为一个扫描间隔(SWATH),每个间隔窗口的扫描时间设定为100ms,那么该扫描范围累计需要32个SWATH((1200-400)/25=32),完成一次扫描需要3.2秒。因此DIA模式能够提供较为全面的离子信息,但是谱图复杂程度较高。虽然可通过设置较窄的隔离窗口降低谱图的复杂度,但是随着隔离窗口数目的增多将导致DIA扫描时间大大延长。

Orbitrap Astral高分辨率质谱仪解决了以上问题,即在扫描速度较高的情况下,仍然具有较好的分辨率和灵敏度。Orbitrap Astral高分辨率质谱仪结合了四极杆质量分析器、Orbitrap质量分析器以及Astral非对称轨道无损质量分析器,具有较高的分辨率、灵敏度以及更深的覆盖范围。

Orbitrap Astral首先将全质量范围的前体离子注入Orbitrap,从而实现MS1全扫描,同时进行一系列的MS2扫描。Orbitrap的分辨率为24万,200Hz的扫描速度,DIA的隔离窗口可窄至2Da,从而提高离子的选择性何定性定量的准确性。如此,1秒内可以完成两次MS1全扫,和接近200次MS/MS二级扫描,大大提升扫描速度。

服务流程

服务内容及说明

服务内容及说明 

我司优势

1、相对与其他类型的样本,植物样本具有随时获取的特点;

2、从样本前处理、上机检测、实验报告到专业的售后服务,提供一站式的蛋白质组学服务;

3、使用先进的质谱仪,提供高灵敏度、高通量的分析,为获得高质量的数据保驾护航;

4、DIA不会造成低丰度蛋白的缺失,可鉴定到更多的蛋白信息;

5、可根据客户的需求提供个性化的分析服务。

适用场景

1、疾病标志物筛选;

2、作用机制研究;

3、植物抗逆研究;

4、药物作用靶点研究;

5、特殊功能蛋白质筛选;

6、物种蛋白质草图构建。

实验周期

自送样起30个工作日。

DIA定量蛋白质组学优点

1、对蛋白质的扫描无差别、无遗漏,不会造成低丰度蛋白的缺失;

2、定量准确性高;

3、鉴定到的蛋白质数量更多。

DIA定量蛋白质组学缺点

1、扫描的时间会更长;

2、难以排除背景蛋白或者污染蛋白的干扰;

3、数据量非常大,数据解析存在一定的难度。

客户下单及项目信息填写

在我司官网http://plant.biorun.com/进行注册或登录,请客户按照页面提示填写项目名称、选择项目类型、填写个人信息及联系方式,提交项目所需要的具体信息,包括:

1、样品来源、含量、状态及其他基本信息;

2、尽可能丰富的相关资料、文献。

实验信息

实验过程中客户可以随时登入管理系统查看项目实时进展情况。实验结题时系统会通过短信自动通知客户,并发送实验报告查看网址。实验结题后,实验报告、检测结果可在线查看或打印,并永久保留。

实验交付内容

1、提供完整的结题报告;

2、输出结构.pdf文件(输出结果的结构展示);

3、蛋白鉴定、定量信息,以及基于蛋白定量信息的差异蛋白筛选、火山图、PCA图和聚类分析等基础分析结果;

4、当每组生物重复3个以上,至少2组时,提供各比较组差异蛋白的GO、KEGG、COG注释与富集分析结果,以及基于STRING数据库的蛋白互作网络分析结果。

文献示例

在线询价


基础信息

  • 1. 您可以通过电子邮件、电话或在线与我们联系。
  • 2. 对于批量订单,请发送至邮箱market@biorun.com,欢迎电话垂询400-027-0273。