背景说明

ChIP-Seq的原理是通过ChIP特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段，并对其进行纯化与文库构建，然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序。通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上，从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段信息。

图 ChIP-seq分析工作流程示意图。（A）样品制备和测序；（B）规范ChIP-seq分析中的计算分析，使用标准化读取分布实现各种分析（Nakato R, Sakata T., 2021）。

服务内容及说明

适用范围

1、用于组蛋白修饰、特定转录子调控作用等表观遗传学的研究；

2、研究组蛋白共价修饰与基因表达的关系；

3、CTCF转录因子研究；

4、解决细胞分化，染色质动态图谱、疾病发生发展等生物学问题；

5、对基因调控机制及基因调控网络进行更深入的研究；

6、对疾病病理机制的研究深入至基因异常表达的源头。

实验周期

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客户下单及项目信息填写

在我司官网http://www.biorun.com/进行注册或登录，请客户按照页面提示填写项目名称、选择项目类型、填写个人信息及联系方式，提交项目所需要的具体信息，包括：

1、组织、细胞等样品来源、状态、ChIP检测专用抗体（也可以选择由我司提供）及其他相关信息；

2、尽可能丰富的相关资料、文献。

实验信息

实验过程中客户可以随时登入管理系统查看项目实时进展情况。实验结题时系统会通过短信自动通知客户，并发送实验报告查看网址。实验结题后，实验报告，检测结果可在线查看或打印，并永久保留。

实验交付内容

1、所有实验的原始数据（包括实验过程、实验试剂与设备等）；

2、表观组学基础数据分析与样本间差异分析（生物信息学分析）；

3、生物信息学分析内容包括：基因组比对分析、峰图分析及注释、基因组分布、峰关联基因GO注释分析、峰关联基因KEGG分析等。

文献示例

图 ChIP-seq结果示意图（Schmidt et al., 2009）。

参考文献

Nakato R, Sakata T. Methods for ChIP-seq analysis: A practical workflow and advanced applications. Methods. 2021;187:44-53.

Schmidt D, Wilson MD, Spyrou C, et al. ChIP-seq: using high-throughput sequencing to discover protein-DNA interactions. Methods. 2009;48(3):240-248.