背景说明
单细胞测序不仅仅是对一个细胞进行测序,而是能够对单一细胞的基因组(scDNA-seq)、转录组(scRNA-seq)、表观组(scDNA-Met-seq)进行高通量测序分析,可以理解为单细胞水平上的测序,即获取单个细胞遗传信息的一项新技术。
该技术能够揭示单个细胞独有的基因结构和基因表达状态,包括结构变异、拷贝数变异、RNA表达水平等数据,反映细胞间的异质性,使不同细胞类型得以精确区分,并有助于科学家在单细胞水平进行分子机制研究。其在肿瘤、发育生物学、微生物学、神经科学等领域发挥重要作用,正成为生命科学研究的焦点。
图 单细胞测序原理(Tang et al., 2019)。
传统的测序方法一般获得的信息来自于混合细胞样品,这样测序的方式往往丢失了细胞的异质性信息。单细胞测序技术结合优化的NGS测序技术,在检测单个细胞之间的异质性、识别稀有细胞、绘制细胞图谱等方面具有极大优势。
服务流程
客户在线下单——订单/实验材料确认——材料准备——单细胞分离——DNA/RNA提取——文库构建——高通量测序——数据分析——结果交付
服务内容及说明
适用范围
1、最常见的单细胞测序应用是在肿瘤学的研究上(如:肿瘤细胞的异质性及微环境研究);
2、分析稀有的细胞,特别是特定时空环境下的细胞;
3、临床上,对体外受精胚胎进行植入前的筛查;
4、组织/器官细胞图谱的构建;
5、阐明分化过程中或跨时间或不同状态的基因表达变化;
6、识别在不同条件(例如治疗或疾病)的特定细胞类型中差异表达的基因;
7、在结合空间、调节和蛋白质表达信息的同时,探索细胞类型之间的表达变化。
实验周期
致电详询
客户下单及项目信息填写
在我司官网http://www.biorun.com/进行注册或登录,请客户按照页面提示填写项目名称、选择项目类型、填写个人信息及联系方式,提交项目所需要的具体信息,包括:
1、组织、细胞等样品来源、状态及其他相关信息;
2、尽可能丰富的相关资料、文献。
实验信息
实验过程中客户可以随时登入管理系统查看项目实时进展情况。实验结题时系统会通过短信自动通知客户,并发送实验报告查看网址。实验结题后,实验报告,检测结果可在线查看或打印,并永久保留。
实验交付内容
1、所有实验的原始数据(包括实验过程、实验试剂与设备等);
2、表观组学基础数据分析与样本间差异分析(生物信息学分析);
3、生物信息学分析内容包括:基因组比对分析、峰图分析及注释、基因组分布、火山图分析、可视化分析等。
文献示例
图 单细胞RNA-seq信息和单细胞的分子多样性(Zhong et al., 2018)。
参考文献
Tang X, Huang Y, Lei J, et al. The single-cell sequencing: new developments and medical applications. Cell Biosci. 2019; 9: 53.
Zhong S, Zhang S, Fan X, et al. A single-cell RNA-seq survey of the developmental landscape of the human prefrontal cortex. Nature. 2018;555(7697):524-528.