背景说明
RNA Pull-down作为研究RNA与蛋白互作的核心技术,是使用体外转录法标记生物素RNA探针,然后与胞浆蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合,通过生物素与链霉亲和素的非共价亲和作用,使其与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后,如果检测蛋白为已知蛋白,可通过Western blot实验检测特定RNA结合蛋白是否与RNA相互作用;如果检测未知蛋白,则可结合质谱(MS)进行鉴定特定RNA结合蛋白,以鉴定蛋白质类型。
图 RNA Pull-down流程图
服务流程
客户在线下单——订单/实验材料确认——样品预处理——生物素探针标记RNA——RNA抽提——细胞裂解——磁珠富集RNA——RNA结合蛋白孵育——RNA结合蛋白洗脱——Western blot或LC-MS/MS检测——出具实验报告
服务内容及说明
适用范围
1、验证已知RNA与蛋白的相互作用;
2、筛选与已知RNA相互作用的未知蛋白。
客户下单及项目信息填写
在我司官网http://www.biorun.com/进行注册或登录,请客户按照页面提示填写项目名称、选择项目类型、填写个人信息及联系方式,提交项目所需要的具体信息,包括:
1、组织、细胞等样品类型及目的基因种属、ID号与序列等相关信息;
2、样本数量、检测方法(可选WB或MS);
3、尽可能丰富的相关资料、文献。
注:样品量直接影响提取蛋白的含量,最终影响富集蛋白量;动物组织中脂肪等物质存在影响;植物叶片组织叶绿素等物质丰度较高存在影响。
实验信息
实验过程中客户可以随时登入管理系统查看项目实时进展情况。实验结题时系统会通过短信自动通知客户,并发送实验报告查看网址。实验结题后,实验报告、检测结果可在线查看或打印,并永久保留。
实验周期
致电详询
优势特点
1、可富集检测低丰度RBPs-RNAs复合物;
2、体外直接转录目的RNA作为诱饵,避免了RNA互补探针导致的非特异性结果;
3、质谱鉴定具有高效、通量大的特点,可一次性获得可能与目的RNA互作的蛋白。
实验交付与标准
1、所有实验的原始数据(包括实验过程、实验试剂与设备等);
2、详细实验报告及结果分析(可选Western blot或MS结果);
3、RNA探针详情、基因合成测序报告以及目的基因质粒、菌液,测序报告。