背景说明
全基因组sgRNA文库可同时对多个细胞的不同基因进行编辑,之后,辅以特定的筛选方案,通过功能性筛选和富集、PCR扩增、NGS测序和生信分析等手段,可确认符合条件的相关基因。
由于基因组序列中原间隔序列邻近模块序列(protospacer adjacent motif,PAM)的广泛存在,运用CRISPR/Cas9技术基本能实现对基因组中所有基因的编辑。CRISPR/Cas9 sgRNA文库结合高通量筛选技术具有广泛的应用前景,既可以在全基因组范围筛选发现新靶点,还可以快速准确地找到与某种表型相关的基因或基因群。
在基于CRISPR基因组编辑筛选方法中,最关键的步骤是构建包含靶点信息的文库。用于高通量筛选的文库通常以两种方式呈现:阵列文库和混合文库。前者是将反应物置于芯片或孔板中,保证不同实验组之间互不影响,可广泛应用于各种细胞类型,且支持多种检测手段;后者是将待筛选文库混合,通过一定的实验方法富集阳性克隆,最终通过高通量测序等方法获得结果,制备方便,能够更全面地覆盖全基因组。
图 CRISPR-SCREEN流程图
服务流程
客户在线下单——订单/实验材料确认——gRNA文库设计——gRNA文库扩增——gRNA文库病毒包装(推荐慢病毒)——gRNA文库筛选——PCR扩增——NGS测序——结果交付
服务内容及说明
适用范围
1、探索药物作用机制:药物靶点确定与验证;
2、寻找肿瘤治疗靶点:基因环路上下游调控机制分析;
3、探究代谢疾病治疗机制:代谢通路调节机制分析。
客户下单及项目信息填写
在我司官网http://www.biorun.com/进行注册或登录,请客户按照页面提示填写:目的基因信息、载体要求、gRNAs要求等。
实验信息
实验过程中客户可以随时登入管理系统查看项目实时进展情况。实验结题时系统会通过短信自动通知客户,并发送实验报告查看网址。实验结题后,实验报告、检测结果可在线查看或打印,并永久保留。
实验周期
致电详询
实验交付与标准
1、所有实验的原始数据(包括实验过程、实验试剂与设备等);
2、gRNA文库质粒:一份质粒、一份大肠杆菌菌液(25%甘油菌);
3、gRNAs详情。
文献示例
图 全基因组人类 CRISPR-Cas9 sgRNA 文库(Gonçalves et al., 2021)。
参考文献
Gonçalves E, Thomas M, Behan FM, et al. Minimal genome-wide human CRISPR-Cas9 library. Genome Biol. 2021;22(1):40.